Gerade, als der Sieg über die Achsenmächte sicher schien, kam es im eigenen Land zu einer Katastrophe. Während die Helden an der Heimatfront tapfer gegen die fast besiegte 5. Kolonne kämpften, drohte eine andere Gefahr, die Ideale der westlichen Welt in ihren Grundfesten zu erschüttern. Der als Nemesis bekannte Superschurke, der seit Ende des Ersten Weltkriegs nicht mehr gesehen worden war, hatte sich jahrzehntelang in den Vereinigten Staaten versteckt gehalten und seinen nächsten Anschlag geplant. In Jahren sorgfältiger Planung hatte Nemesis einen großen Anteil der Waffenindustrie unter seine Kontrolle gebracht. Durch seine Vertreter und Schergen hatte er nicht nur Zugang zur neuesten Militärtechnik sondern auch zu großen Geldsummen, die er für die Aufstellung seiner eigenen Geheimarmee verwendete. Während Amerika noch an seinem Kater nach den Festlichkeiten anlässlich des VE-Days laborierte, schlug Nemesis zu.

Kurz vor dem Morgengrauen rief der preußische Prinz der Automatons sein stummes Gefolge fanatischer Roboter zusammen und positionierte sie in Reichweite von Washington DC. Als die Sonne über dem Kapitol aufging, ließen düsengetriebene Kampf-Roboter einen Hagel aus Raketenfeuer und verheerenden nuklearen Strahlen auf das Weiße Haus niederprasseln. Nemesis und seinen Clockwork-Truppen gelang es schnell, das Militär und die zum Schutz von Präsident Truman bestellten Helden zu überrumpeln, sodass diesem nur dank eines gut platzierten Helden mit Teleportationskräften die Flucht gelang. Nemesis hatte die meisten Kongressmitglieder und den gesamten Obersten Gerichtshof als Geiseln in seine Gewalt gebracht. Dann inszenierte er eine feierliche Zeremonie auf der Treppe des Kapitols, bei der er den obersten Richter dazu zwang, ihn als Kaiser von ganz Amerika auszurufen.

Dies war die unerwartete Bedrohung, die bei der Rückkehr der Helden von der anderen Seite des Atlantiks zuhause auf sie wartete. Als die ersten Helden, angeführt von Statesman und der Freedom Phalanx, in Amerika landeten, fanden sie ihr Heimatland in einer Lage vor, die selbst ihre schlimmsten Befürchtungen übertraf. Nemesis hatte in den zwanzig größten Städten der USA mit Nervengas gefüllte Bomben versteckt. Mit einem einzigen Knopfdruck setzte er die tödlichen Gase frei. Für Millionen Menschen bedeutete dies einen qualvollen Tod, sei denn, sie bekamen binnen vierundzwanzig Stunden ein Gegengift verabreicht.

Was folgte, war eine der schrecklichsten Stunden im Leben der Helden. Die weltberühmten Hüter des Friedens lieferten sich in den Straßen der Hauptstadt mit tödlichen Robotern und mit Atomwaffen ausgerüsteten Truppen einen verzweifelten Kampf. Zu guter Letzt standen die Helden auf den Treppen des Kapitols dem genialen Schurken selbst gegenüber. Nemesis war auf sie vorbereitet und feuerte seinen Atomstrahl in die Ansammlung, der sofort dutzende Helden tötete. Sister Psyche jedoch gelang es inmitten dieses Chaos, mithilfe ihrer telepathischen Fähigkeiten den Aufbewahrungsort des Gegengifts aus Nemesis’ Gedanken zu lesen. Die restlichen Helden hatten vor der Attacke des metallbeschlagenen Monsters den Rückzug angetreten.

Verwundet aber noch bewegungsfähig floh Sister Psyche vom Schauplatz des Blutvergießens und informierte die Armee. Innerhalb weniger Stunden war es Dr. Mnemonic gelungen, eine durch die Luft übertragbare Version des Gegengiftes zu synthetisieren, welche die Luftwaffe mit Unterstützung der Helden unverzüglich über den infizierten Städten versprühte. Das Gift von Nemesis wurde neutralisiert und Washington umstellt. Hunderte Helden hielten auf das Kapitol zu und sammelten sich für einen zweiten Ansturm auf die Hauptstadt. Sie kämpften sich durch die übrig gebliebenen Streitkräfte des Schurken und glaubten, auch Nemesis selbst besiegt zu haben, bis sich herausstellte, dass sie nur einen Roboter, der genau wie Nemesis aussah, gestellt hatten. Nemesis war erneut entkommen.

Obwohl Nemesis verloren hatte, war der durch ihn verursachte Schaden unleugbar. Wichtiger war jedoch, dass die vorangegangenen Ereignisse eine neue Ära für Superhelden auf der gesamten Welt und insbesondere in Paragon City einläuteten. Mit dem Sieg über die Achsenmächte, dem Verschwinden der 5. Kolonne und den erfolgreichen Schlägen gegen das organisierte Verbrechen vor dem Krieg war Paragon City zu einem bemerkenswert sicheren Ort geworden. Die Schurkerei jedoch verabscheute ein solches Vakuum und Nemesis hatte ein Exempel statuiert und bewiesen, dass ein einzelnes Individuum mit außergewöhnlichen Kräften, böswilligen Ambitionen und genug treuen Schergen eine ganze Nation herausfordern konnte. Nemesis hatte zwar versagt, aber es gab nun dennoch genügend andere, die es ihm nachtun wollten, ohne dabei seine Fehler zu wiederholen. Das Zeitalter der Superschurken hatte begonnen.

Viele der Superschurken, die in den spätern 40er- und 50er-Jahren auftauchten, waren ehemalige Helden, denen das Schicksal übel mitgespielt hatte. Obwohl sie im ganzen Land als Helden gepriesen worden waren, war manchen der Stolz des Vaterlandes nicht genug Lohn. Sie sahen sich nicht mehr als Schützer der Menschheit, sondern als überlegene Wesen. Und als überlegene Wesen schuldete die Welt ihnen doch sicher mehr als allen anderen. Sie waren sogar davon überzeugt, dass sie das Recht hatten, sich zu nehmen, was immer sie wollten, denn schließlich hatte die Welt eine Schuld zu begleichen. Und dabei war ihnen jedes Mittel recht.

Obwohl die Gegenwart dieser neuen Superschurken im ganzen Land spürbar war, wurde Paragon City zum Zentrum ihrer Aktivitäten. Als reichste Stadt der Nation, die vielen ehemaligen Superhelden eine Heimat bot, war Paragon City der ideale Nährboden für das Böse. Ohne Verbrechersyndikate, die ihnen ihr Territorium streitig machen konnten, hatten die Super-Kriminellen mehr als genug Spielraum, um ihre frevelhaften Ziele zu verfolgen. Unter den vielen legendären Schurken, die in dieser Ära ihr Unwesen trieben, waren die Revolverheldin Calamity Jane, der lebensgefährliche Schurke Feathered Serpent aus Mittelamerika, der listige Huckster, die mysteriöse Jade Maiden, der Tod bringende Rakhasha, und eine Mannschaft von Rächern, die nur als die Horde bekannt war. Ihre Aktivitäten reichten von einfachen bewaffneten Raubüberfällen über Diebstahl, Mord und Körperverletzung bis zu gelegentlichen Versuchen, die Weltherrschaft an sich zu reißen.

Letztendlich stellten diese Schurken weder einzeln noch in Gruppen eine Bedrohung in der Größenordnung von Nemesis dar. Vielen mangelte es einfach an bösartigem Intellekt, doch für die meisten bedeutete spätestens die nun aktiv gewordenen Heldengemeinde in Paragon City das Aus. Die Polizei konnte wenig gegen die superkraft-gestärkten Gauner unternehmen, doch die Helden der Stadt nahmen die Herausforderung mit Vergnügen an. 1952 beschloss die Stadt, das revolutionäre Bürgerwehrgesetz zu erweitern. Nun erlaubte es auch Gruppen von Helden mit offizieller Lizenz, ihre Mitglieder mit der Bekämpfung des Verbrechens zu beauftragen. Die Freedom Phalanx wurde 1953 die erste Gruppe, die ihren Nutzen aus dem neuen Gesetz zog; Dawn Patrol und Midnight Squad folgten ihr auf dem Fuße.

So gelang es den Helden trotz des Anstiegs der Superschurken-Kriminalität, Paragon City durch ihre tapferen und selbstlosen Bemühungen zu einem vergleichsweise sicheren (und interessanten) Ort zu machen und dem Verbrechen Einhalt zu gebieten. Doch als die Wogen daheim sich glätteten und die Dinge wieder ihren gewohnten Lauf nahmen, begann das Unheil aus dem Ausland zu drohen. Fast sofort nach Kriegsende hatten die USA und die Sowjetunion einen immer erbitterter werdenden kalten Krieg begonnen. Es wurde nun offenbar, dass es in diesem Wettrüsten nicht nur um nukleare Waffen ging, sondern auch um eine andere, genauso mächtige Waffe: Superhelden.